Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a2Q07643 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms