Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AmbpQ07456 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AmbpQ07456 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AmbpQ07456 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AmbpQ07456 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms