Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Aplp2Q06335 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aplp2Q06335 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms