Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox10Q04888 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox10Q04888 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms