Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1Q04750 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms