Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcad1Q04692 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcad1Q04692 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms