Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl7Q03366 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl7Q03366 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms