Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacna1sQ02789 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms