Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col6a2Q02788 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms