Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb5Q02739 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb5Q02739 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms