Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms