Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms