Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms