Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms