Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms