Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms