Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax8Q00288 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms