Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms