Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
rp9P97762 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
rp9P97762 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
rp9P97762 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
rp9P97762 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
rp9P97762 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
rp9P97762 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
rp9P97762 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
rp9P97762 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
rp9P97762 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms