Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms