Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkp1P97350 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms