Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms