Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcgP82348 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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