Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp9xP70398 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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