Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msx3P70354 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msx3P70354 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.4 ms