Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad1P70340 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms