Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp7P70280 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms