Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hoxd13P70217 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd13P70217 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hoxd13P70217 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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