Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms