Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ThraP63058 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ThraP63058 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ThraP63058 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ThraP63058 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ThraP63058 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ThraP63058 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ThraP63058 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ThraP63058 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms