Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms