Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap1s1P61967 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap1s1P61967 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap1s1P61967 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap1s1P61967 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms