Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PlnP61014 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PlnP61014 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
PlnP61014 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PlnP61014 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PlnP61014 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms