Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms