Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms