Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Senp1P59110 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Senp1P59110 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Senp1P59110 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms