Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csrnp3P59055 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms