Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opa1P58281 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opa1P58281 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opa1P58281 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms