Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpdl3bP58242 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms