Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TdgP56581 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TdgP56581 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TdgP56581 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TdgP56581 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms