Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf5P56477 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irf5P56477 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms