Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtswP56203 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtswP56203 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtswP56203 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtswP56203 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtswP56203 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtswP56203 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtswP56203 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms