Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn1P54254 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn1P54254 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn1P54254 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn1P54254 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn1P54254 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn1P54254 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn1P54254 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn1P54254 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn1P54254 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn1P54254 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn1P54254 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn1P54254 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn1P54254 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn1P54254 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn1P54254 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn1P54254 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms