Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RabggtbP53612 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RabggtbP53612 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms