Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClgnP52194 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClgnP52194 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms