Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr5P51682 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr5P51682 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms