Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TubP50586 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TubP50586 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TubP50586 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TubP50586 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms