Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpdP50404 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms