Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtpreP49446 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PtpreP49446 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PtpreP49446 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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PtpreP49446 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PtpreP49446 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PtpreP49446 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PtpreP49446 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtpreP49446 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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