Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CitP49025 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CitP49025 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CitP49025 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CitP49025 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms